Pendirian Perguruan Tinggi Muhammadiyah di Kabupaten Kepulauan Selayar berawal dari Musyawarah Daerah Muhammadiyah Kabupaten Kepulauan Selayar ke-18 di Benteng Selayar yang memandatkan kepada jajaran Pimpinan Daerah Muhammadiyah Kepulauan Selayar untuk mengupayakan berdirinya kelas paralel atau kelas jauh dari Perguruan Tinggi Muhammadiyah yang ada di kabupaten tetangga. PDM Selayar kemudian membangun komunikasi dengan Pimpinan Universitas Muhammadiyah Bulukumba (UMB). Tahun 2021, UMB membuat GWA bersama dan menerbitkan SK Pengelola UMB Kelas Selayar. Upaya ini dalam perjalanannya menemui beberapa kendala, antara lain karena aktivitas yang terbatas oleh Covid-19.

PDM Kepulauan Selayar melalui SK Nomor 75/KEP/III.0/D/2021 kemudian membentuk Tim Pendirian Perguruan Tinggi Muhammadiyah Selayar dengan komposisi Tim sebagai berikut:

Tim Penasihat                : Drs.Abdullah, M.Pd., H.Saiful Arif, SH., dan Muhammad Husni, S.Ag.,

Tim Pengarah                : Prof. Dr. Drs. Akbar Silo, MS., dan Prof. Dr. Raden Partino, M.Pd. 

• Ketua                     : Muhammad Ihsan Maro, S.Ag., M.Si., 
• Sekretaris              : Fajar Sidik, SE., 
• Bendahara             : Yanuar Taufik, S.Sos., 
• Anggota                : H.Muhammad Arsyad, S.Sos., MM., Drs. H. Ruknuddin, MM., Asnawi Dahlan, ST., dan Hasimuddin, S.Pd.I. 
• Staf Administrasi  : Muhammad Rijal, S.I.Kom., Adisucipto, S.Pd. 

Pada level Pimpinan Wilayah Muhammadiyah Sulawesi Selatan didampingi oleh :

• Prof. Dr. Gagaring Pagalung, SE., MS., Ak.CA., 
• Prof. Dr. Irwan Akib, M.Pd. 
• Dr. Ir. H. Muhammad Syaiful Saleh, M.Si. 

Di tingkat Majelis Diktilitbang PP Muhammadiyah antara lain didampingi oleh Prof. Drs. Ahmad, MPd., PhD. 

Awalnya. PTM yang diupayakan didirikan bernama Universitas Muhammadiyah Selayar (UMS). Namun setelah diusulkan, ternyata pendirian perguruan tinggi dalam bentuk universitas sementara moratorium, sehingga berubah menjadi Institut Teknologi Sains dan Bisnis Muhammadiyah Selayar. Jadi boleh dikata, kehadiran ITSBM Selayar adalah perwujudan selangkah lebih maju dari apa yang dimandatkan oleh Musyawarah Daerah Muhammadiyah Kabupaten Kepulauan Selayar ke-18 tersebut. 

Institut Teknologi Sains dan Bisnis Muhammadiyah Selayar didirikan berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan, Riset dan Teknologi, Nomor 108/E/O/2022 Tanggal 21 Pebruari 2022 yang membina 4 Program Studi yaitu:

1. Teknologi Hasil Perikanan [S1 Ilmu Terapan], 
2. Program Studi Kewirausahaan [S1 Ilmu Terapan], 
3. Program Studi Ilmu Komputer [S1 Ilmu Terapan], 
4. Program Studi Administrasi Kesehatan [S1 Ilmu Formal].

Institut Teknologi Sains dan Bisnis Muhammadiyah Selayar kemudian menjadi Perguruan Tinggi pertama yang didirikan di Kepulauan Selayar. Untuk menggerakkan roda organisasi dan tatakelola perguruan tinggi, untuk pertama kalinya, telah dilantik Prof. Dr. Drs. Akbar Silo, MS. sebagai Rektor berdasarkan Keputusan Pimpinan Pusat Muhammadiyah Nomor 504/KEP/I.0/D/2022 tanggal 2 Juni 2022, dan Muhammad Ihsan Maro, S.Ag., M.Si. sebagai Wakil Rektor, berdasarkan Keputusan Majelis Diktilitbang Pimpinan Pusat Muhammadiyah tanggal 1 Juli 2022, untuk masa jabatan 2022 – 2026.

Selanjutnya, Institut Teknologi Sains dan Bisnis Muhammadiyah Selayar, menyelenggarakan kegiatan akademik di Kompleks Perguruan Muhammadiyah Jl. Kartini Nomor 17 Benteng Selayar. Dan, dalam pengembangannya, aktif membuka diri melakukan kerjasama kemitraan dengan berbagai pihak yang relevan.